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条带出现干扰?目标蛋白不够?这些NF-κB p65的实验关键点你掌握了吗?

发布时间:2020-12-01 点击数:8675

NF-κB p65 由于蛋白的特殊性质与磷酸化、乙酰化修饰,在实验中需要特别注意。

 

小艾这次整理了在不同实验中检测这个蛋白的注意事项,帮助您获得预期实验结果。

 

NF-κB p65 实验关键点

 

NF-κB p65 简介

 

图1. NF-κB 信号通路。☞图片来源 Wikipedia

 

哺乳动物 NF-κB 由 5 个亚基组成,包括 p50-NF-κB1,p52-NF-κB2,c-Rel,p65-RelA 和 RelB。它们在体内形成有功能的同源或异源多聚体。

 

NF-κB p65 常参与炎症反应。在静息细胞中,NF-κB 主要定位于细胞质,少量以非活性复合物位于细胞核。在激活的细胞中,NF-κB 进入细胞核并激活下游相关基因转录。NF-κB 的转录活性由 p65 亚基的磷酸化或乙酰化调控。

 

NF-κB 信号通路可通过下述压力刺激诱导:自由基氧化、紫外线辐射 (UV)、 肿瘤坏死因子 α (TNFα)、白细胞介素 1-beta(IL-1β)、病原体相关分子模式 (PAMPs) 或细菌脂多糖 (LPS)。NF-κB 与记忆和突触可塑性相关,而异常蛋白质水平则与癌症有关。

 

NF-κB p65 的 WB 检测 

 

由于NF-κB p65 有很多翻译后修饰,且部分定位于细胞核,为了得到理想的实验结果,小艾建议在制备样品中注意以下几点:

 

1

在裂解样品时加入蛋白酶抑制剂,检测磷酸化或乙酰化 p65 时加入磷酸酶或去乙酰酶抑制剂 HDACi(TSA + 烟酰胺)(图2)。

2

对样品进行超声处理以富集更多的目标蛋白。

3

实验过程中将样品置于冰上

 

图2. 检测 HeLa 细胞中 NF-κB p65 phospho S276。

Lane 1:

未处理 HeLa 全细胞裂解液

Lane 2:

100ng/ml Calyculin A 处理 30min,然后使用20ng/ml TNF-α处理5min  HeLa 细胞全裂解液

Lane 3:

100ng/ml Calyculin A 处理30 min,然后使用 20ng/ml TNF-α 处理 5min,再用碱性磷酸酶处理 1 小时 HeLa 细胞全裂解液 

 

为了确保有足够的蛋白被检测到并防止非特异反应,在电泳及检测时推荐:

 

1

使用 Bradford、Lowry 或 BCA 方法对总蛋白进行定量(图3)。

2

进行 SDS-PAGE 时每个泳道加入 20-50μg 总蛋白。

3

检测磷酸化蛋白时使用 BSA 进行封闭

 

图3. 检测不同样本中 NF-κB p65 表达情况

Lane 1:人胎儿脑裂解液

Lane 2:人胎儿肾裂解液

Lane 3:人胎儿肺裂解液

向上滑动查看参考文献

1.  Bo-Hwa Choi, Da-Hyun Lee, Jin Kim, Ju-Hee Kang, Chang-Shin Park, Controls of Nuclear Factor-Kappa B Signaling Activity by 5'-AMP-Activated Protein Kinase Activation With Examples in Human Bladder Cancer Cells. Int Neurourol J. 2016 Sep;20(3):182-187.

 

2.  Arenzana-Seisdedos F, Thompson J, Rodriguez MS, Bachelerie F, Thomas D, Hay RT. Inducible nuclear expression of newly synthesized I kappa B alpha negatively regulates DNA-binding and transcriptional activities of NF-kappa B. Mol Cell Biol 1995;15:2689-96.

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