条带出现干扰?目标蛋白不够?这些NF-κB p65的实验关键点你掌握了吗?
NF-κB p65 由于蛋白的特殊性质与磷酸化、乙酰化修饰,在实验中需要特别注意。
小艾这次整理了在不同实验中检测这个蛋白的注意事项,帮助您获得预期实验结果。
NF-κB p65 实验关键点
NF-κB p65 简介

图1. NF-κB 信号通路。☞图片来源 Wikipedia
哺乳动物 NF-κB 由 5 个亚基组成,包括 p50-NF-κB1,p52-NF-κB2,c-Rel,p65-RelA 和 RelB。它们在体内形成有功能的同源或异源多聚体。
NF-κB p65 常参与炎症反应。在静息细胞中,NF-κB 主要定位于细胞质,少量以非活性复合物位于细胞核。在激活的细胞中,NF-κB 进入细胞核并激活下游相关基因转录。NF-κB 的转录活性由 p65 亚基的磷酸化或乙酰化调控。
NF-κB 信号通路可通过下述压力刺激诱导:自由基氧化、紫外线辐射 (UV)、 肿瘤坏死因子 α (TNFα)、白细胞介素 1-beta(IL-1β)、病原体相关分子模式 (PAMPs) 或细菌脂多糖 (LPS)。NF-κB 与记忆和突触可塑性相关,而异常蛋白质水平则与癌症有关。
NF-κB p65 的 WB 检测
由于NF-κB p65 有很多翻译后修饰,且部分定位于细胞核,为了得到理想的实验结果,小艾建议在制备样品中注意以下几点:
1 |
在裂解样品时加入蛋白酶抑制剂,检测磷酸化或乙酰化 p65 时加入磷酸酶或去乙酰酶抑制剂 HDACi(TSA + 烟酰胺)(图2)。 |
2 |
对样品进行超声处理以富集更多的目标蛋白。 |
3 |
实验过程中将样品置于冰上。 |
为了确保有足够的蛋白被检测到并防止非特异反应,在电泳及检测时推荐:
1 |
使用 Bradford、Lowry 或 BCA 方法对总蛋白进行定量(图3)。 |
2 |
进行 SDS-PAGE 时每个泳道加入 20-50μg 总蛋白。 |
3 |
检测磷酸化蛋白时使用 BSA 进行封闭。 |